Els mòduls EDI solen consistir en diversos components clau que funcionen conjuntament per estandarditzar i automatitzar la transmissió de dades entre empreses. A grans trets, es poden dividir en una capa de conversió de dades, una capa de transmissió de comunicacions, una capa de mapes empresarials i una capa d'integració de sistemes, cadascuna amb les seves pròpies responsabilitats.
El mòdul de conversió i mapeig de dades és un dels components bàsics de l'EDI. És l'encarregat de convertir les dades en brut dels sistemes interns de l'empresa (com les dades ERP o CRM) en missatges EDI conformes amb formats estàndard, com EDIFACT o ANSI X12. Simultàniament, també és responsable de l'anàlisi inversa de les dades de socis externs, convertint-les en dades estructurades reconeixibles pels sistemes interns de l'empresa. Les regles de mapeig de camp i les regles de validació de dades tenen un paper crucial en aquest procés.
El mòdul de comunicació i transmissió és el principal responsable de la transmissió segura de missatges EDI entre diferents empreses. Els mètodes habituals inclouen xarxes VAN, protocols AS2 o mètodes de transmissió basats en API-. Normalment, aquest mòdul també inclou cues de missatges, mecanismes de reintent i supervisió de l'estat de transmissió per garantir un lliurament de dades fiable fins i tot en entorns de xarxa complexos.
El mòdul de gestió i integració del sistema s'utilitza per integrar les capacitats EDI als sistemes empresarials existents de l'empresa. Normalment està profundament integrat amb ERP, WMS o sistemes de gestió de la cadena de subministrament per automatitzar processos empresarials com ara el processament de comandes, l'enviament i la reconciliació. Simultàniament, aquest mòdul proporciona funcions de registre, gestió d'excepcions i monitorització, facilitant el seguiment i la gestió dels processos d'intercanvi de dades per a les empreses.